يعين الوزير رئيس المجلس التنسيقي لشركات أرباب الطوائف ومقدمي خدمة حجاج الخارج من بين الأعضاء ، ويختار المجلس من بين أعضائه نائباً للرئيس ليساعده في أداء مهامه ومسؤولياته .
تعيين الأمين العام للمجلس .
إعداد الخطط الاستراتيجية للمجلس وسياساته وأهدافه .
الرفع بالمواضيع التي توجه بها الوزارة .
دراسة الموضوعات التي يرى الوزير عرضها على المجلس وإبداء وجهة النظر فيها .
اعتماد الخطط والسياسات اللازمة لتنمية موارد المجلس و إدارة أنشطته واستثماراته والرقابة عليه وفق ما تقضي به الأنظمة والتعليمات .
إقرار الهيكل التنظيمي للمجلس وأجهزته وفروعه .
تحديد واعتماد آليات التمويل وتوزيع حصص دعم صندوق المجلس من قبل شركات أرباب الطوائف .
إعداد واعتماد اللائحة التنفيذية والحوكمة للمجلس التنسيقي .
طرح سبل تنمية موارد المجلس التنسيقي ككيان مستقل بما في ذلك الاستثمار .
تقييم أداء الأمانة العامة وأجهزتها وفروعها واعتماد تقاريرها السنوية .
اعتماد التقرير الدوري الذي تعده الأمانة العامة مع تزويد اللجان التنسيقية للأعمال والخدمات المشتركة بنسخة منه وفق ما تقضي به الأنظمة والتعليمات .
اعتماد المدير المالي والمستشار القانوني واللجان المتخصصة .
اعتماد تعيين مراقب الحسابات.
اعتماد التقارير المحاسبية المقدمة من مراقب الحسابات المعتمد.